Prodi PENGELOLAAN PELABUHAN PERIKANAN POLITEKNIK PERTANIAN NEGERI PANGKAJENE KEPULAUAN merupakan kelompok Prodi SAINTEK untuk Program Diploma IV (D4). Daya tampung tahun 2021 untuk SBMPTN adalah sejumlah 16 mahasiswa, sedangkan untuk SNMPTN adalah sejumlah 20 mahasiswa.